NGS 102 --- Day 3

java -jar GenomeAnalysisTK-2.8-1-g932cd3a/GenomeAnalysisTK.jar -R human_g1k_v37.fasta -T VariantsToTable -V intermediates/output.recalibrated.filtered.vcf -F POS -F QD -F FILTER -F MQ -F HET -F HOM-VAR -F REF -F ALT -o results.table -L 1 -raw